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药物这个概念之所以成立，根本上是因为生命体制的物质性；而药物的局限性，也同样是因为生命体制的物质性所受到的局限。
所谓本草药物学，是指中医传统当中的药物学。

中医传统背景下的药物学所具有的几个特点，源自其受到的环境约束：
1，采用植物、动物、矿物的宏观分体，例如，茎、叶、果、花、等等，而无法做到选择分子层面的单体（纯净矿物除外），是因为中医对于生命体制的分析，仅仅止于宏观层面；
2，由此带来的利弊，几乎是同等程度的。其弊，就是相对分子层面的现代西药，中药不得不采用大剂量，并且，不得不采用多种药物，进行相互调配颉颃，以抑制副作用，突出主作用；其利，则是药物的组方复杂性，为应对疾病机制的复杂性，提供了良好的颉颃调度空间。
这样一种局势，就为中医理论带来了极大的挑战：必须为如此复杂的组方任务，提供可靠有效的理论指导。
整体而言，中医几千年来在此所获得的成就，还是非常之高的。其中的一个典范，就是张仲景的伤寒组方体系。