药物这个概念之所以成立，根本上是因为生命体制的物质性；而药物的局限性，也同样是因为生命体制的物质性所受到的局限。
所谓本草药物学，是指中医传统当中的药物学。

中医传统背景下的药物学所具有的几个特点，源自其受到的环境约束：
1，采用植物、动物、矿物的宏观分体，例如，茎、叶、果、花、等等，而无法做到选择分子层面的单体（纯净矿物除外），是因为中医对于生命体制的分析，仅仅止于宏观层面；

主要内容参见：高等医学

如果是从现代生理的角度，医学的宗旨，是系统的有限调节。
如果是从精神的角度，医学则是以物质的手段，把人体调整到平常状态。

医学的目的
医学的目的，第一就是揭示病理，第二就是探求治疗方法。

医学的第一原则就是，人体是不完善的。第一问题就是，人体的哪些不完善导致其不能良好应对环境不良因素或不良变化？当然，这里的“不完善”、“良好”、“不良”都是相对词汇。
实际上，应该还有一个第零原则，就是，人体是不可能完善的，而环境不良因素总是存在的。

所谓高等医学，乃是从人的高等机能着眼，设置医学修复的方案。
何谓人的高等机能，精神、心理，生理系统的高级层次、等等，都可谓为高等机能，乃是相对人体之各个系统层面而言。

迄今为止，在高等医学方面最具有经验和成就的，是中国传统医学。
所以从高等医学的角度来重新认识中国传统医学，是首先要做的事情。同时，也要力求现代医学能够面向高等医学。

伦敦经济学院的心理学家Satoshi Kanazawa在研究进化心理学时，所使用的两个概念，general intelligence和specific intelligence，是比较有意义的。

层次结构

一旦我们认识到基因对于整个生命的意义，以下的观念就很自然了：

“疾病是体内细胞变异的表象，细胞变异是细胞内基因受损的表象”，因此，一切疾病都可以被认为是基因病。

但是，这个观念只涉及到事情的一少部分。
那就是，这个表述图像的因果链是破碎的。
何以故？
说到底，所谓基因，只是人体的信息载体，在人这个生命体制当中，信息，只是一个环节，尽管是非常重要的环节，但绝对不是整个生命体制当中，所有因果链的头端。

现代生理学的研究方法本身，决定了，其未知远比已知更为重要。
所以，这里我更关注的是，在已知的边界，从方法论的角度，来探讨未知的可能性问题。

分子、细胞层次：

* 基因
* 细胞信号系统，细胞组织损伤和修复，细胞适应
* 细胞生命周期
* 毒性，自由基
在这个部分，主要讨论【还原论的问题】。

基本疾病过程：

* 水、电解质代谢
* 酸碱平衡
* 局部血液循环障碍，缺氧
* 发热，炎症
* 各个层次的应激反应
* 休克
* 肿瘤
在这个部分，主要讨论【系统的现象与系统的调节】这两者的关系的问题。

器官层次：

* 神经系统
* 心血管系统
* 呼吸系统