基因的突变

在进化的角度，基因的核心问题，最原始的看法，是突变。
为什么说是最原始的看法呢？
很显然，假设基因所记载的信息是严格不变的，不仅体细胞中的基因，无论怎样分裂、复制、特化，其信息都不变；而且在生殖细胞中也不变，仅仅在两性生殖过程中，雌雄两性母细胞结合，才出现基因的新组合。那么，很多现象就无法解释。
所以，就提出突变的概念，用来描述不变的反面。

但是，这样一来，很有可能，基因所载信息的非两性结合的所出现的改变，是有多种类型的，甚至各有其不同意义，现在，我们统一称之为突变，这就可能导致我们忽略到很多重要的事情。

层次结构

一旦我们认识到基因对于整个生命的意义，以下的观念就很自然了：

“疾病是体内细胞变异的表象，细胞变异是细胞内基因受损的表象”，因此，一切疾病都可以被认为是基因病。

但是，这个观念只涉及到事情的一少部分。
那就是，这个表述图像的因果链是破碎的。
何以故？
说到底，所谓基因，只是人体的信息载体，在人这个生命体制当中，信息，只是一个环节，尽管是非常重要的环节，但绝对不是整个生命体制当中，所有因果链的头端。

现代生理学的研究方法本身，决定了，其未知远比已知更为重要。
所以，这里我更关注的是，在已知的边界，从方法论的角度，来探讨未知的可能性问题。

分子、细胞层次：

* 基因
* 细胞信号系统，细胞组织损伤和修复，细胞适应
* 细胞生命周期
* 毒性，自由基
在这个部分，主要讨论【还原论的问题】。

基本疾病过程：

* 水、电解质代谢
* 酸碱平衡
* 局部血液循环障碍，缺氧
* 发热，炎症
* 各个层次的应激反应
* 休克
* 肿瘤
在这个部分，主要讨论【系统的现象与系统的调节】这两者的关系的问题。

器官层次：

* 神经系统
* 心血管系统
* 呼吸系统